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Table 1 Taxonomic distribution of DUF164 proteins and RpoN in the domain Bacteria

From: The zinc-ribbon domain of Helicobacter pylori HP0958: requirement for RpoN accumulation and possible roles of homologs in other bacteria

Taxonomic group aNumber of genomes with both DUF164 protein and RpoN aNumber of genomes with DUF164 protein only aNumber of genomes with RpoN only aNumber of genomes with neither DUF164 protein nor RpoN
Acidobacteria 2 (2) 0 (0) 1 (1) 0 (0)
Actinobacteria 1 (2) 73 (143) 0 (0) 16 (37)
Aquificae 6 (8) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Bacteroidetes 24 (80) 0 (2) 0 (0) 2 (4)
Chlamydiae 15 (22) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Chlorobi 11 (12) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Chloroflexi 1 (2) 3 (3) 3 (5) 6 (6)
Cyanobacteria 0 (0) 0 (0) 0 (0) 38 (51)
Deferribacteres 0 (1) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Dictyoglomi 0 (0) 2 (2) 0 (0) 0 (0)
Elusimicrobia 0 (0) 1 (1) 0 (0) 1 (1)
Fibrobacteres 0 (0) 0 (0) 1 (2) 0 (0)
Firmicutes 17 (23) 0 (1) 76 (240) 100 (243)
   Clostridia 17 (23) 0 (1) 25 (71) 11 (55)
Clostridium 12 (16) 0 (1) 10 (39) 3 (12)
Fusobacteria 0 (0) 0 (0) 0 (12) 4 (8)
Gemmatimonadetes 1 (1) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Lentisphaerae 2 (2) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Nitrospirae 1 (1) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Planctomycetes 3 (7) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Alphaproteobacteria 0 (0) 0 (0) 79 (122) 42 (75)
Betaproteobacteria 0 (0) 0 (0) 69 (141) 3 (4)
Deltaproteobacteria 32 (41) 0 (1) 1 (1) 0 (0)
Epsilonproteobacteria 22 (43) 4 (5) 0 (2) 0 (1)
Gammaproteobacteria 0 (0) 0 (0) 199 (368) 44 (71)
Magnetococci 0 (0) 0 (0) 1 (1) 0 (0)
Zetaproteobacteria 0 (0) 0 (0) 0 (1) 0 (0)
Spirochaetes 10 (27) 2 (3) 6 (6) 0 (0)
Synergistetes 0 (0) 0 (0) 1 (3) 0 (1)
Tenericutes 0 (0) 0 (0) 0 (0) 25 (40)
Thermi 0 (0) 5 (8) 0 (0) 0 (0)
Thermotogae 0 (0) 0 (0) 3 (3) 8 (9)
TM7 0 (0) 0 (0) 0 (0) 0 (1)
Verrucomicrobia 3 (6) 0 (0) 0 (1) 0 (0)
WWE1 1 (1) 0 (0) 0 (0) 0 (0)
Total 150 (281) 90 (169) 440 (909) 289 (552)
  1. aNumbers outside parentheses indicate results from analysis of finished genome sequence, while numbers within parentheses indicate results for both finished and unfinished genome sequences.